MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 75029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008209	CGG	2	6	1773	1778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677422
2	NC_008209	GGCC	2	8	1872	1879	0 %	0 %	50 %	50 %	110677422
3	NC_008209	AAG	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677422
4	NC_008209	CGCA	2	8	1922	1929	25 %	0 %	25 %	50 %	110677422
5	NC_008209	CCA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677422
6	NC_008209	CG	3	6	1984	1989	0 %	0 %	50 %	50 %	110677422
7	NC_008209	CGA	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677422
8	NC_008209	AAC	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677422
9	NC_008209	CACGG	2	10	2077	2086	20 %	0 %	40 %	40 %	110677422
10	NC_008209	GCC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
11	NC_008209	GAT	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677422
12	NC_008209	GAC	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677422
13	NC_008209	CAT	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677422
14	NC_008209	CTG	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677422
15	NC_008209	CTG	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677422
16	NC_008209	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
17	NC_008209	CCG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677422
18	NC_008209	GACAAG	2	12	2836	2847	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	110677422
19	NC_008209	GCA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677423
20	NC_008209	GCC	2	6	2982	2987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
21	NC_008209	CGC	2	6	3006	3011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
22	NC_008209	CCG	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
23	NC_008209	CG	3	6	3361	3366	0 %	0 %	50 %	50 %	110677423
24	NC_008209	GTGC	2	8	3376	3383	0 %	25 %	50 %	25 %	110677423
25	NC_008209	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677423
26	NC_008209	TTCG	2	8	3452	3459	0 %	50 %	25 %	25 %	110677423
27	NC_008209	ATT	2	6	3465	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677423
28	NC_008209	GCC	2	6	3482	3487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677423
29	NC_008209	GCC	2	6	3559	3564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
30	NC_008209	C	6	6	3563	3568	0 %	0 %	0 %	100 %	110677424
31	NC_008209	AAAGCC	2	12	3571	3582	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	110677424
32	NC_008209	CGC	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
33	NC_008209	CGT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677424
34	NC_008209	ATGA	2	8	3715	3722	50 %	25 %	25 %	0 %	110677424
35	NC_008209	CGG	2	6	3767	3772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
36	NC_008209	CGA	2	6	3804	3809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677424
37	NC_008209	GAT	2	6	3963	3968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677424
38	NC_008209	GGGC	2	8	3987	3994	0 %	0 %	75 %	25 %	110677424
39	NC_008209	GAT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677424
40	NC_008209	CA	3	6	4146	4151	50 %	0 %	0 %	50 %	110677424
41	NC_008209	CGG	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
42	NC_008209	CCG	2	6	4199	4204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677424
43	NC_008209	ATGG	2	8	4211	4218	25 %	25 %	50 %	0 %	110677424
44	NC_008209	GAA	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677424
45	NC_008209	GGTG	2	8	4311	4318	0 %	25 %	75 %	0 %	110677424
46	NC_008209	CTG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677424
47	NC_008209	GCG	2	6	4352	4357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
48	NC_008209	CGG	2	6	4380	4385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677424
49	NC_008209	CTGG	2	8	4449	4456	0 %	25 %	50 %	25 %	110677424
50	NC_008209	AAG	3	9	4457	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110677424
51	NC_008209	CATGC	2	10	4488	4497	20 %	20 %	20 %	40 %	110677424
52	NC_008209	CGA	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
53	NC_008209	TTCC	2	8	4592	4599	0 %	50 %	0 %	50 %	110677425
54	NC_008209	AGC	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
55	NC_008209	CGG	2	6	4685	4690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677425
56	NC_008209	GGTC	2	8	4699	4706	0 %	25 %	50 %	25 %	110677425
57	NC_008209	TCGATG	2	12	4720	4731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110677425
58	NC_008209	GGA	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110677425
59	NC_008209	CGCTGG	2	12	4902	4913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110677425
60	NC_008209	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677425
61	NC_008209	ACG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
62	NC_008209	T	6	6	5114	5119	0 %	100 %	0 %	0 %	110677425
63	NC_008209	GC	3	6	5168	5173	0 %	0 %	50 %	50 %	110677425
64	NC_008209	CAG	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
65	NC_008209	GC	3	6	5203	5208	0 %	0 %	50 %	50 %	110677425
66	NC_008209	CGG	2	6	5214	5219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677425
67	NC_008209	GAC	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
68	NC_008209	GCT	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677425
69	NC_008209	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677425
70	NC_008209	CCGT	2	8	5516	5523	0 %	25 %	25 %	50 %	110677425
71	NC_008209	GAC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677425
72	NC_008209	CG	3	6	5696	5701	0 %	0 %	50 %	50 %	110677426
73	NC_008209	G	6	6	5730	5735	0 %	0 %	100 %	0 %	110677426
74	NC_008209	CATG	2	8	5790	5797	25 %	25 %	25 %	25 %	110677426
75	NC_008209	TGA	2	6	5883	5888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677426
76	NC_008209	ATT	2	6	5914	5919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110677426
77	NC_008209	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677426
78	NC_008209	TTGC	2	8	6184	6191	0 %	50 %	25 %	25 %	110677426
79	NC_008209	TTC	2	6	6241	6246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677426
80	NC_008209	ATG	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677426
81	NC_008209	AC	3	6	6346	6351	50 %	0 %	0 %	50 %	110677427
82	NC_008209	A	7	7	6392	6398	100 %	0 %	0 %	0 %	110677427
83	NC_008209	A	6	6	6412	6417	100 %	0 %	0 %	0 %	110677427
84	NC_008209	CCA	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677427
85	NC_008209	GCCT	2	8	6491	6498	0 %	25 %	25 %	50 %	110677427
86	NC_008209	GC	3	6	6520	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	110677427
87	NC_008209	AAC	2	6	6576	6581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110677427
88	NC_008209	CCTGCT	2	12	6658	6669	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	110677427
89	NC_008209	GCG	2	6	6718	6723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
90	NC_008209	GCG	2	6	6759	6764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
91	NC_008209	GT	3	6	6765	6770	0 %	50 %	50 %	0 %	110677427
92	NC_008209	GCG	2	6	6786	6791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
93	NC_008209	GC	4	8	6801	6808	0 %	0 %	50 %	50 %	110677427
94	NC_008209	GTCC	2	8	6811	6818	0 %	25 %	25 %	50 %	110677427
95	NC_008209	CGG	2	6	6843	6848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
96	NC_008209	GCC	4	12	6917	6928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677427
97	NC_008209	GAT	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677427
98	NC_008209	C	6	6	7080	7085	0 %	0 %	0 %	100 %	110677427
99	NC_008209	GCG	2	6	7202	7207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
100	NC_008209	CGA	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677427
101	NC_008209	GGC	2	6	7249	7254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
102	NC_008209	GGC	2	6	7297	7302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677427
103	NC_008209	GCG	2	6	7547	7552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677428
104	NC_008209	ATG	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677428
105	NC_008209	C	7	7	7680	7686	0 %	0 %	0 %	100 %	110677428
106	NC_008209	GCTG	2	8	7789	7796	0 %	25 %	50 %	25 %	110677428
107	NC_008209	TGC	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677428
108	NC_008209	ATC	2	6	7859	7864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677428
109	NC_008209	CTG	2	6	7962	7967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677428
110	NC_008209	GC	3	6	8004	8009	0 %	0 %	50 %	50 %	110677428
111	NC_008209	CCGTGA	2	12	8022	8033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110677428
112	NC_008209	CG	3	6	8052	8057	0 %	0 %	50 %	50 %	110677428
113	NC_008209	GAC	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
114	NC_008209	GGC	2	6	8291	8296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
115	NC_008209	CGG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
116	NC_008209	TCTT	2	8	8436	8443	0 %	75 %	0 %	25 %	110677429
117	NC_008209	CGC	2	6	8507	8512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
118	NC_008209	GC	5	10	8675	8684	0 %	0 %	50 %	50 %	110677429
119	NC_008209	TTCG	2	8	8732	8739	0 %	50 %	25 %	25 %	110677429
120	NC_008209	GGT	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
121	NC_008209	GTG	2	6	8913	8918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110677429
122	NC_008209	ACG	2	6	8922	8927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
123	NC_008209	TCC	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110677429
124	NC_008209	CAT	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110677429
125	NC_008209	GCA	2	6	8986	8991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
126	NC_008209	GC	4	8	9196	9203	0 %	0 %	50 %	50 %	110677429
127	NC_008209	CGA	2	6	9220	9225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110677429
128	NC_008209	ATG	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677429
129	NC_008209	CGT	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
130	NC_008209	CTG	2	6	9530	9535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110677429
131	NC_008209	GC	3	6	9546	9551	0 %	0 %	50 %	50 %	110677429
132	NC_008209	CGG	2	6	9601	9606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677429
133	NC_008209	GT	3	6	9628	9633	0 %	50 %	50 %	0 %	110677429
134	NC_008209	CCG	2	6	9718	9723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110677429
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253	NC_008209	G	6	6	15305	15310	0 %	0 %	100 %	0 %	110677434
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260	NC_008209	CGG	2	6	15511	15516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677434
261	NC_008209	TCT	2	6	15520	15525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110677434
262	NC_008209	CGG	4	12	15541	15552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110677434
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266	NC_008209	TGA	2	6	15589	15594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110677434
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388	NC_008209	CCA	3	9	21279	21287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110677438
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